Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC93Q567U6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC93Q567U6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC93Q567U6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms