Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRMT12Q53H54 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRMT12Q53H54 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms