Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9L6

TMEM119, Transmembrane protein 119, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM119Q4V9L6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMEM119Q4V9L6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM119Q4V9L6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM119Q4V9L6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms