Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Q3C1V9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Q3C1V9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q3C1V9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q3C1V9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q3C1V9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q3C1V9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q3C1V9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q3C1V9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q3C1V9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q3C1V9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q3C1V9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q3C1V9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q3C1V9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Q3C1V9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q3C1V9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q3C1V9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q3C1V9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q3C1V9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Q3C1V9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Q3C1V9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q3C1V9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q3C1V9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q3C1V9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q3C1V9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q3C1V9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Q3C1V9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q3C1V9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q3C1V9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q3C1V9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Q3C1V9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Q3C1V9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Q3C1V9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Q3C1V9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Q3C1V9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Q3C1V9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q3C1V9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q3C1V9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q3C1V9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q3C1V9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Q3C1V9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Q3C1V9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Q3C1V9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Q3C1V9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Q3C1V9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Q3C1V9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Q3C1V9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Q3C1V9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q3C1V9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q3C1V9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q3C1V9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q3C1V9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q3C1V9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q3C1V9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q3C1V9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q3C1V9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q3C1V9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q3C1V9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q3C1V9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q3C1V9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q3C1V9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q3C1V9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q3C1V9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Q3C1V9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q3C1V9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q3C1V9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q3C1V9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q3C1V9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q3C1V9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q3C1V9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q3C1V9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q3C1V9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Q3C1V9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Q3C1V9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Q3C1V9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q3C1V9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q3C1V9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Q3C1V9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q3C1V9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q3C1V9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q3C1V9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q3C1V9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q3C1V9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q3C1V9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q3C1V9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q3C1V9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q3C1V9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Q3C1V9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Q3C1V9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Q3C1V9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Q3C1V9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Q3C1V9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Q3C1V9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Q3C1V9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Q3C1V9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Q3C1V9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Q3C1V9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Q3C1V9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q3C1V9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q3C1V9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms