Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
COL24A1Q17RW2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COL24A1Q17RW2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL24A1Q17RW2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms