Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CA9Q16790 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CA9Q16790 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CA9Q16790 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CA9Q16790 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CA9Q16790 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CA9Q16790 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CA9Q16790 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CA9Q16790 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CA9Q16790 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CA9Q16790 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CA9Q16790 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CA9Q16790 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CA9Q16790 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CA9Q16790 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CA9Q16790 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CA9Q16790 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CA9Q16790 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CA9Q16790 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CA9Q16790 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CA9Q16790 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CA9Q16790 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CA9Q16790 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CA9Q16790 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CA9Q16790 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CA9Q16790 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CA9Q16790 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CA9Q16790 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CA9Q16790 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CA9Q16790 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CA9Q16790 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CA9Q16790 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CA9Q16790 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CA9Q16790 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CA9Q16790 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CA9Q16790 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CA9Q16790 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CA9Q16790 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CA9Q16790 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CA9Q16790 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CA9Q16790 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CA9Q16790 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CA9Q16790 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CA9Q16790 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CA9Q16790 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CA9Q16790 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CA9Q16790 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CA9Q16790 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CA9Q16790 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CA9Q16790 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CA9Q16790 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CA9Q16790 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CA9Q16790 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CA9Q16790 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CA9Q16790 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CA9Q16790 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CA9Q16790 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CA9Q16790 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CA9Q16790 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CA9Q16790 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CA9Q16790 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CA9Q16790 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CA9Q16790 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CA9Q16790 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CA9Q16790 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CA9Q16790 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CA9Q16790 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CA9Q16790 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CA9Q16790 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CA9Q16790 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CA9Q16790 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CA9Q16790 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CA9Q16790 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CA9Q16790 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CA9Q16790 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CA9Q16790 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CA9Q16790 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CA9Q16790 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CA9Q16790 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CA9Q16790 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CA9Q16790 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CA9Q16790 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CA9Q16790 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CA9Q16790 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CA9Q16790 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CA9Q16790 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CA9Q16790 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CA9Q16790 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CA9Q16790 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CA9Q16790 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CA9Q16790 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CA9Q16790 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CA9Q16790 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CA9Q16790 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CA9Q16790 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CA9Q16790 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CA9Q16790 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CA9Q16790 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CA9Q16790 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CA9Q16790 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
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