Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NECTIN1Q15223 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NECTIN1Q15223 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NECTIN1Q15223 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms