Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPNMBQ14956 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GPNMBQ14956 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GPNMBQ14956 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
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