Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTP4A2Q12974 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTP4A2Q12974 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTP4A2Q12974 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms