Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 YMR010WYMR010W 1218 nt5.02□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 MFA2YNL145W 117 nt5.02□□□□□ -1.61 RIP-Chip
PUF2Q12221 ETT1YOR051C 1239 nt5.02□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 ATG1YGL180W 2694 nt5.02□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 HAP1YLR256W 4509 nt5.02□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 SLD2YKL108W 1362 nt5.02□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 BRE2YLR015W 1518 nt5.02□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 SLT2YHR030C 1455 nt5.01□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 UGA2YBR006W 1494 nt5.01□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 RPT2YDL007W 1314 nt5.01□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 SNM1YDR478W 597 nt5.01□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 PSR1YLL010C 1284 nt5.01□□□□□ -1.61 RIP-Chip
PUF2Q12221 NEJ1YLR265C 1029 nt5.01□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 CTR3YLR411W 726 nt5.01□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 MAC1YMR021C 1254 nt5.01□□□□□ -1.61 RIP-Chip
PUF2Q12221 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt5.01□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 YBR016WYBR016W 387 nt5.01□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 OAZ1YPL052W 879 nt5.01□□□□□ -1.61 RIP-Chip
PUF2Q12221 VPS28YPL065W 729 nt5.01□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 ADE3YGR204W 2841 nt5.01□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 ATE1YGL017W 1512 nt5.01□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 NFI1YOR156C 2181 nt5.01□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 MMT2YPL224C 1455 nt5□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 YAP1802YGR241C 1707 nt5□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 VTC2YFL004W 2487 nt5□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 NTH2YBR001C 2343 nt5□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 YNL095CYNL095C 1929 nt5□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 YDL121CYDL121C 450 nt5□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 URA3YEL021W 804 nt5□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 MPS2YGL075C 1164 nt5□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 VPS29YHR012W 849 nt5□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 MID2YLR332W 1131 nt5□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 YLR402WYLR402W 192 nt5□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 MGR2YPL098C 342 nt5□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 BIT2YBR270C 1638 nt5□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 STD1YOR047C 1335 nt4.99□□□□□ -1.61 RIP-Chip
PUF2Q12221 COT1YOR316C 1320 nt4.99□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 LCB2YDR062W 1686 nt4.99□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 RGT1YKL038W 3513 nt4.99□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 UBC6YER100W 753 nt4.99□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 YJL193WYJL193W 1209 nt4.99□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 MIM2YLR099W-A 264 nt4.99□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 UBA3YPR066W 900 nt4.99□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 UBS1YBR165W 834 nt4.99□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 STE12YHR084W 2067 nt4.99□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 CYK3YDL117W 2658 nt4.99□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 ATR1YML116W 1629 nt4.98□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 TRS23YDR246W 660 nt4.98□□□□□ -1.61 RIP-Chip
PUF2Q12221 RML2YEL050C 1182 nt4.98□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 FMP48YGR052W 1110 nt4.98□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 SKI6YGR195W 741 nt4.98□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 CAB4YGR277C 918 nt4.98□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 YJL215CYJL215C 360 nt4.98□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 MCX1YBR227C 1563 nt4.98□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 MRE11YMR224C 2079 nt4.98□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 YMD8YML038C 1329 nt4.97□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 FAA4YMR246W 2085 nt4.97□□□□□ -1.61 RIP-Chip
PUF2Q12221 RPS16BYDL083C 432 nt4.97□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 TRP4YDR354W 1143 nt4.97□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt4.97□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 RUF21RUF21 707 nt4.97□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 SSP2YOR242C 1116 nt4.97□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 YOR289WYOR289W 756 nt4.97□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 YOR342CYOR342C 960 nt4.97□□□□□ -1.61 RIP-Chip
PUF2Q12221 MET31YPL038W 534 nt4.97□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 GIP1YBR045C 1920 nt4.97□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 DBF2YGR092W 1719 nt4.97□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 MAD3YJL013C 1548 nt4.97□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 RRN3YKL125W 1884 nt4.96□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 MNN2YBR015C 1794 nt4.96□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 MIF2YKL089W 1650 nt4.96□□□□□ -1.61
PUF2Q12221 ASF2YDL197C 1578 nt4.96□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 EXO1YOR033C 2109 nt4.96□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 NOP16YER002W 696 nt4.96□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 PCL1YNL289W 840 nt4.96□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 YOL050CYOL050C 321 nt4.96□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 GCR2YNL199C 1605 nt4.96□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 HXT14YNL318C 1623 nt4.96□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 NGL2YMR285C 1548 nt4.96□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 MCH4YOL119C 1506 nt4.96□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 DOA1YKL213C 2148 nt4.96□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 IPI3YNL182C 1668 nt4.96□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 VPS36YLR417W 1701 nt4.95□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 MLF3YNL074C 1359 nt4.95□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 RSM10YDR041W 612 nt4.95□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 INO2YDR123C 915 nt4.95□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 YMR245WYMR245W 621 nt4.95□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt4.95□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 YPL113CYPL113C 1191 nt4.95□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 CLA4YNL298W 2529 nt4.95□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 GAS3YMR215W 1575 nt4.95□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 AIM10YER087W 1731 nt4.94□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 NRD1YNL251C 1728 nt4.94□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 HRR25YPL204W 1485 nt4.94□□□□□ -1.62 RIP-Chip
PUF2Q12221 HXT5YHR096C 1779 nt4.94□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 SLC1YDL052C 912 nt4.94□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 YGR011WYGR011W 327 nt4.94□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 YHL045WYHL045W 348 nt4.94□□□□□ -1.62 RIP-Chip
PUF2Q12221 SPC34YKR037C 888 nt4.94□□□□□ -1.62
PUF2Q12221 YKR104WYKR104W 921 nt4.94□□□□□ -1.62
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