Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPIRE1Q08AE8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPIRE1Q08AE8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms