Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL6Q02878 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL6Q02878 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms