Protein–RNA interactions for Protein: Q01649

CIK1, Spindle pole body-associated protein CIK1, yeastyeast

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CIK1Q01649 YER085CYER085C 522 nt4.94□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 MMS2YGL087C 414 nt4.94□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 RMR1YGL250W 726 nt4.94□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 MRM1YOR201C 1239 nt4.94□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 NAT3YPR131C 588 nt4.94□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 UBC4YBR082C 447 nt4.94□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt4.94□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 VHC1YBR235W 3363 nt4.94□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 HIR2YOR038C 2628 nt4.93□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 RAD16YBR114W 2373 nt4.93□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 YDR261C-DYDR261C-D 4815 nt4.93□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 PAN1YIR006C 4443 nt4.93□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 SCS2YER120W 735 nt4.93□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 ARC1YGL105W 1131 nt4.93□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 CPS1YJL172W 1731 nt4.93□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 MTC2YKL098W 1074 nt4.93□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 COG5YNL051W 1212 nt4.93□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 YPL114WYPL114W 420 nt4.93□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 YPR195CYPR195C 330 nt4.93□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 DSD1YGL196W 1287 nt4.92□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 SSP120YLR250W 705 nt4.92□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 PDX3YBR035C 687 nt4.92□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 GRE1YPL223C 507 nt4.92□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 OPY2YPR075C 1083 nt4.92□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 CDC28YBR160W 897 nt4.92□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 ZRC1YMR243C 1329 nt4.92□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 PUF3YLL013C 2640 nt4.92□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 LAP3YNL239W 1365 nt4.91□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 KRE6YPR159W 2163 nt4.91□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 RSC6YCR052W 1452 nt4.91□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 GEP3YOR205C 1671 nt4.91□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 TDA11YHR159W 1515 nt4.91□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 TUB3YML124C 1338 nt4.91□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 FAA3YIL009W 2085 nt4.9□□□□□ -1.62
CIK1Q01649 YCL065WYCL065W 369 nt4.9□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 YDL119CYDL119C 924 nt4.9□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 TFB3YDR460W 966 nt4.9□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 PCT1YGR202C 1275 nt4.9□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 YHL049CYHL049C 816 nt4.9□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 PGU1YJR153W 1086 nt4.9□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 YLL017WYLL017W 312 nt4.9□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 SNO1YMR095C 675 nt4.9□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 TRE1YPL176C 2352 nt4.9□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 MSC7YHR039C 1935 nt4.89□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 MNT2YGL257C 1677 nt4.89□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 GAS2YLR343W 1668 nt4.89□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 FRS1YLR060W 1788 nt4.89□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 CDC19YAL038W 1503 nt4.89□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 CBP4YGR174C 513 nt4.89□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 PGA3YML125C 939 nt4.89□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 HOT1YMR172W 2160 nt4.89□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 GGA1YDR358W 1674 nt4.89□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 OCT1YKL134C 2319 nt4.89□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 YDR444WYDR444W 2064 nt4.88□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 FRE1YLR214W 2061 nt4.88□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 COQ4YDR204W 1008 nt4.88□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 YRA1YDR381W 681 nt4.88□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 MMS21YEL019C 804 nt4.88□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 YKR075CYKR075C 924 nt4.88□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 PSR1YLL010C 1284 nt4.88□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 HIS4YCL030C 2400 nt4.88□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 MST1YKL194C 1389 nt4.88□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 KCC4YCL024W 3114 nt4.88□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 HXT14YNL318C 1623 nt4.87□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 KIN28YDL108W 921 nt4.87□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 YPT32YGL210W 669 nt4.87□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 TIM21YGR033C 720 nt4.87□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 PAN6YIL145C 930 nt4.87□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 YIL163CYIL163C 354 nt4.87□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 QCR2YPR191W 1107 nt4.87□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 THI20YOL055C 1656 nt4.86□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 SHE10YGL228W 1734 nt4.86□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 RGP1YDR137W 1992 nt4.86□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 MDR1YGR100W 2853 nt4.86□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 PFA5YDR459C 1125 nt4.86□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 CPR6YLR216C 1116 nt4.86□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 EMP46YLR080W 1335 nt4.86□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 ASA1YPR085C 1332 nt4.86□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 BRL1YHR036W 1416 nt4.86□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 MEF2YJL102W 2460 nt4.86□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 STB2YMR053C 2553 nt4.86□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 SKM1YOL113W 1968 nt4.85□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 MOB2YFL034C-B 864 nt4.85□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 MNN11YJL183W 1269 nt4.85□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 PRP45YAL032C 1140 nt4.85□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 RPS31YLR167W 459 nt4.85□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 MRPL22YNL177C 930 nt4.85□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 snR19snR19 568 nt4.85□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 GAS4YOL132W 1416 nt4.85□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 KTR7YIL085C 1554 nt4.85□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 HFA1YMR207C 6372 nt4.85□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 NUP116YMR047C 3342 nt4.84□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 LEU1YGL009C 2340 nt4.84□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 ATG20YDL113C 1923 nt4.84□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 STP4YDL048C 1473 nt4.84□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 ULA1YPL003W 1389 nt4.84□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt4.84□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 RRP45YDR280W 918 nt4.84□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 CIA2YHR122W 696 nt4.84□□□□□ -1.63
CIK1Q01649 MIM2YLR099W-A 264 nt4.84□□□□□ -1.63
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