Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC00205P59089 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00205P59089 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms