Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIK1P57059 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SIK1P57059 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIK1P57059 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIK1P57059 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIK1P57059 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIK1P57059 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIK1P57059 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIK1P57059 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIK1P57059 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIK1P57059 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SIK1P57059 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIK1P57059 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIK1P57059 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIK1P57059 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SIK1P57059 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIK1P57059 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIK1P57059 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SIK1P57059 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIK1P57059 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIK1P57059 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIK1P57059 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIK1P57059 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIK1P57059 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SIK1P57059 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIK1P57059 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIK1P57059 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIK1P57059 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIK1P57059 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SIK1P57059 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIK1P57059 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIK1P57059 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIK1P57059 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SIK1P57059 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SIK1P57059 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIK1P57059 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIK1P57059 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIK1P57059 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIK1P57059 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIK1P57059 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIK1P57059 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIK1P57059 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIK1P57059 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIK1P57059 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SIK1P57059 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIK1P57059 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIK1P57059 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIK1P57059 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SIK1P57059 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIK1P57059 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIK1P57059 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIK1P57059 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIK1P57059 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIK1P57059 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIK1P57059 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIK1P57059 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIK1P57059 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIK1P57059 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SIK1P57059 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIK1P57059 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIK1P57059 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIK1P57059 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIK1P57059 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIK1P57059 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIK1P57059 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIK1P57059 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIK1P57059 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIK1P57059 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SIK1P57059 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SIK1P57059 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIK1P57059 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SIK1P57059 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIK1P57059 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIK1P57059 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIK1P57059 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SIK1P57059 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIK1P57059 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SIK1P57059 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SIK1P57059 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SIK1P57059 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIK1P57059 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SIK1P57059 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SIK1P57059 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SIK1P57059 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SIK1P57059 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SIK1P57059 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SIK1P57059 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SIK1P57059 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SIK1P57059 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SIK1P57059 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SIK1P57059 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SIK1P57059 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SIK1P57059 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SIK1P57059 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SIK1P57059 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SIK1P57059 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SIK1P57059 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIK1P57059 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIK1P57059 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SIK1P57059 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms