Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT3P49368 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT3P49368 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT3P49368 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT3P49368 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT3P49368 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT3P49368 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT3P49368 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT3P49368 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT3P49368 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT3P49368 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT3P49368 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT3P49368 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT3P49368 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT3P49368 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT3P49368 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT3P49368 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT3P49368 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT3P49368 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT3P49368 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT3P49368 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT3P49368 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT3P49368 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT3P49368 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT3P49368 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT3P49368 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT3P49368 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT3P49368 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT3P49368 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT3P49368 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT3P49368 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT3P49368 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT3P49368 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT3P49368 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT3P49368 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT3P49368 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT3P49368 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCT3P49368 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT3P49368 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT3P49368 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT3P49368 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT3P49368 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT3P49368 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT3P49368 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT3P49368 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCT3P49368 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCT3P49368 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CCT3P49368 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCT3P49368 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCT3P49368 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT3P49368 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT3P49368 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT3P49368 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT3P49368 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT3P49368 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT3P49368 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT3P49368 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT3P49368 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT3P49368 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT3P49368 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT3P49368 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCT3P49368 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT3P49368 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT3P49368 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT3P49368 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT3P49368 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT3P49368 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT3P49368 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT3P49368 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT3P49368 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCT3P49368 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT3P49368 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT3P49368 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT3P49368 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT3P49368 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT3P49368 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT3P49368 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT3P49368 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT3P49368 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT3P49368 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT3P49368 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT3P49368 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT3P49368 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT3P49368 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT3P49368 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCT3P49368 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT3P49368 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT3P49368 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT3P49368 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT3P49368 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT3P49368 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT3P49368 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT3P49368 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT3P49368 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT3P49368 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCT3P49368 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT3P49368 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT3P49368 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT3P49368 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCT3P49368 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms