Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC1A2P43004 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC1A2P43004 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC1A2P43004 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms