Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKN2BP42772 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKN2BP42772 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKN2BP42772 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKN2BP42772 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKN2BP42772 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKN2BP42772 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKN2BP42772 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKN2BP42772 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKN2BP42772 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDKN2BP42772 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDKN2BP42772 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDKN2BP42772 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDKN2BP42772 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDKN2BP42772 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDKN2BP42772 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDKN2BP42772 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms