Protein–RNA interactions for Protein: P41743

PRKCI, Protein kinase C iota type, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCIP41743 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKCIP41743 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKCIP41743 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms