Protein–RNA interactions for Protein: P41732

TSPAN7, Tetraspanin-7, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7P41732 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN7P41732 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN7P41732 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms