Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTPN7P35236 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPN7P35236 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms