Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
VAMP1P23763 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAMP1P23763 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms