Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ITGAMP11215 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGAMP11215 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGAMP11215 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms