Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RARBP10826 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARBP10826 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARBP10826 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARBP10826 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RARBP10826 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARBP10826 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARBP10826 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARBP10826 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARBP10826 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARBP10826 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARBP10826 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RARBP10826 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARBP10826 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RARBP10826 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARBP10826 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARBP10826 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RARBP10826 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RARBP10826 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARBP10826 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARBP10826 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARBP10826 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARBP10826 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARBP10826 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARBP10826 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RARBP10826 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RARBP10826 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARBP10826 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARBP10826 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARBP10826 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARBP10826 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARBP10826 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARBP10826 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RARBP10826 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RARBP10826 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RARBP10826 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RARBP10826 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RARBP10826 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RARBP10826 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RARBP10826 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RARBP10826 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RARBP10826 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARBP10826 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARBP10826 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARBP10826 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARBP10826 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARBP10826 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARBP10826 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARBP10826 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RARBP10826 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARBP10826 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RARBP10826 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARBP10826 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARBP10826 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RARBP10826 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RARBP10826 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RARBP10826 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RARBP10826 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RARBP10826 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RARBP10826 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RARBP10826 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RARBP10826 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RARBP10826 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARBP10826 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARBP10826 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARBP10826 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARBP10826 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARBP10826 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARBP10826 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARBP10826 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARBP10826 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RARBP10826 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARBP10826 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARBP10826 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARBP10826 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARBP10826 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RARBP10826 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARBP10826 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARBP10826 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RARBP10826 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARBP10826 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARBP10826 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARBP10826 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARBP10826 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARBP10826 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RARBP10826 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARBP10826 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARBP10826 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARBP10826 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARBP10826 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARBP10826 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARBP10826 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RARBP10826 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RARBP10826 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RARBP10826 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RARBP10826 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RARBP10826 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RARBP10826 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RARBP10826 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RARBP10826 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms