Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GLI4P10075 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GLI4P10075 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GLI4P10075 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GLI4P10075 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GLI4P10075 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GLI4P10075 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GLI4P10075 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GLI4P10075 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GLI4P10075 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GLI4P10075 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GLI4P10075 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GLI4P10075 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GLI4P10075 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GLI4P10075 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GLI4P10075 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GLI4P10075 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GLI4P10075 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GLI4P10075 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GLI4P10075 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GLI4P10075 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GLI4P10075 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GLI4P10075 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GLI4P10075 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GLI4P10075 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GLI4P10075 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GLI4P10075 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GLI4P10075 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GLI4P10075 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GLI4P10075 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GLI4P10075 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI4P10075 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI4P10075 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI4P10075 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI4P10075 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI4P10075 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI4P10075 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI4P10075 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GLI4P10075 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GLI4P10075 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GLI4P10075 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GLI4P10075 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GLI4P10075 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GLI4P10075 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GLI4P10075 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GLI4P10075 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GLI4P10075 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GLI4P10075 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GLI4P10075 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GLI4P10075 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GLI4P10075 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GLI4P10075 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI4P10075 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI4P10075 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI4P10075 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI4P10075 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI4P10075 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI4P10075 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GLI4P10075 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI4P10075 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI4P10075 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI4P10075 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI4P10075 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI4P10075 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI4P10075 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI4P10075 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI4P10075 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI4P10075 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI4P10075 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GLI4P10075 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GLI4P10075 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GLI4P10075 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GLI4P10075 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GLI4P10075 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GLI4P10075 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GLI4P10075 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GLI4P10075 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GLI4P10075 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GLI4P10075 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GLI4P10075 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI4P10075 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI4P10075 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI4P10075 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI4P10075 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI4P10075 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI4P10075 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI4P10075 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI4P10075 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI4P10075 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI4P10075 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI4P10075 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GLI4P10075 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GLI4P10075 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GLI4P10075 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GLI4P10075 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GLI4P10075 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GLI4P10075 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GLI4P10075 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GLI4P10075 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GLI4P10075 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms