Protein–RNA interactions for Protein: P0CI25

TRIM49, Tripartite motif-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49P0CI25 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM49P0CI25 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM49P0CI25 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM49P0CI25 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM49P0CI25 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM49P0CI25 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM49P0CI25 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM49P0CI25 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM49P0CI25 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM49P0CI25 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM49P0CI25 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM49P0CI25 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM49P0CI25 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM49P0CI25 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM49P0CI25 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM49P0CI25 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM49P0CI25 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM49P0CI25 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM49P0CI25 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM49P0CI25 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.3 ms