Protein–RNA interactions for Protein: O75312

ZPR1, Zinc finger protein ZPR1, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZPR1O75312 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ZPR1O75312 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ZPR1O75312 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms