Protein–RNA interactions for Protein: O75200

NPIPB7, Nuclear pore complex-interacting protein family member B7, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB7O75200 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPIPB7O75200 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPIPB7O75200 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPIPB7O75200 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPIPB7O75200 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NPIPB7O75200 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NPIPB7O75200 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NPIPB7O75200 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NPIPB7O75200 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NPIPB7O75200 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NPIPB7O75200 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NPIPB7O75200 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
NPIPB7O75200 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NPIPB7O75200 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms