Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SELENOFO60613 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SELENOFO60613 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SELENOFO60613 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SELENOFO60613 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SELENOFO60613 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SELENOFO60613 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SELENOFO60613 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SELENOFO60613 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SELENOFO60613 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SELENOFO60613 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SELENOFO60613 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SELENOFO60613 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SELENOFO60613 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SELENOFO60613 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SELENOFO60613 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SELENOFO60613 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SELENOFO60613 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SELENOFO60613 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SELENOFO60613 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms