Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDB2O43679 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LDB2O43679 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDB2O43679 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDB2O43679 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDB2O43679 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LDB2O43679 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDB2O43679 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDB2O43679 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDB2O43679 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDB2O43679 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDB2O43679 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDB2O43679 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LDB2O43679 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDB2O43679 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDB2O43679 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDB2O43679 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LDB2O43679 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LDB2O43679 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LDB2O43679 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LDB2O43679 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LDB2O43679 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDB2O43679 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDB2O43679 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDB2O43679 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDB2O43679 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDB2O43679 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDB2O43679 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDB2O43679 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDB2O43679 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDB2O43679 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDB2O43679 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDB2O43679 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDB2O43679 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDB2O43679 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB2O43679 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB2O43679 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB2O43679 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB2O43679 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB2O43679 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB2O43679 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB2O43679 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB2O43679 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB2O43679 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDB2O43679 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDB2O43679 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDB2O43679 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDB2O43679 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDB2O43679 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDB2O43679 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDB2O43679 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LDB2O43679 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LDB2O43679 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDB2O43679 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDB2O43679 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDB2O43679 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDB2O43679 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDB2O43679 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDB2O43679 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDB2O43679 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDB2O43679 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDB2O43679 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDB2O43679 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDB2O43679 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDB2O43679 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDB2O43679 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LDB2O43679 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDB2O43679 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDB2O43679 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDB2O43679 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDB2O43679 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDB2O43679 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDB2O43679 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDB2O43679 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDB2O43679 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDB2O43679 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDB2O43679 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LDB2O43679 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LDB2O43679 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDB2O43679 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDB2O43679 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDB2O43679 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDB2O43679 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDB2O43679 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDB2O43679 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LDB2O43679 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDB2O43679 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDB2O43679 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDB2O43679 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDB2O43679 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDB2O43679 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDB2O43679 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDB2O43679 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDB2O43679 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDB2O43679 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDB2O43679 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDB2O43679 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDB2O43679 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDB2O43679 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDB2O43679 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms