Protein–RNA interactions for Protein: O15350

TP73, Tumor protein p73, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP73O15350 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TP73O15350 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TP73O15350 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TP73O15350 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TP73O15350 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TP73O15350 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TP73O15350 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TP73O15350 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TP73O15350 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TP73O15350 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TP73O15350 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TP73O15350 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TP73O15350 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TP73O15350 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TP73O15350 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TP73O15350 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TP73O15350 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TP73O15350 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TP73O15350 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TP73O15350 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TP73O15350 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TP73O15350 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TP73O15350 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TP73O15350 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TP73O15350 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TP73O15350 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TP73O15350 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TP73O15350 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TP73O15350 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TP73O15350 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TP73O15350 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TP73O15350 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TP73O15350 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TP73O15350 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TP73O15350 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TP73O15350 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TP73O15350 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TP73O15350 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TP73O15350 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TP73O15350 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TP73O15350 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TP73O15350 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TP73O15350 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TP73O15350 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TP73O15350 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TP73O15350 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TP73O15350 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TP73O15350 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TP73O15350 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TP73O15350 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TP73O15350 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TP73O15350 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TP73O15350 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TP73O15350 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TP73O15350 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TP73O15350 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TP73O15350 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TP73O15350 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TP73O15350 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TP73O15350 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TP73O15350 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TP73O15350 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TP73O15350 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TP73O15350 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TP73O15350 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TP73O15350 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TP73O15350 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TP73O15350 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TP73O15350 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TP73O15350 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TP73O15350 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TP73O15350 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TP73O15350 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TP73O15350 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TP73O15350 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TP73O15350 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TP73O15350 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TP73O15350 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TP73O15350 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TP73O15350 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TP73O15350 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TP73O15350 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TP73O15350 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TP73O15350 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TP73O15350 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TP73O15350 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TP73O15350 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TP73O15350 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TP73O15350 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TP73O15350 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TP73O15350 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TP73O15350 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TP73O15350 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TP73O15350 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TP73O15350 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TP73O15350 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TP73O15350 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TP73O15350 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TP73O15350 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TP73O15350 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms