Protein–RNA interactions for Protein: A6NIN4

Putative uncharacterized protein FLJ38447, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NIN4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A6NIN4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A6NIN4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A6NIN4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A6NIN4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
A6NIN4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
A6NIN4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
A6NIN4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A6NIN4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A6NIN4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A6NIN4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A6NIN4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
A6NIN4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A6NIN4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A6NIN4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A6NIN4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A6NIN4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A6NIN4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A6NIN4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A6NIN4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A6NIN4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A6NIN4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A6NIN4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A6NIN4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A6NIN4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A6NIN4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A6NIN4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A6NIN4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A6NIN4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A6NIN4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A6NIN4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
A6NIN4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A6NIN4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A6NIN4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A6NIN4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A6NIN4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A6NIN4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A6NIN4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A6NIN4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A6NIN4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A6NIN4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A6NIN4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A6NIN4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A6NIN4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
A6NIN4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A6NIN4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A6NIN4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A6NIN4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A6NIN4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A6NIN4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A6NIN4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
A6NIN4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
A6NIN4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
A6NIN4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
A6NIN4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
A6NIN4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
A6NIN4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
A6NIN4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
A6NIN4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
A6NIN4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
A6NIN4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
A6NIN4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
A6NIN4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
A6NIN4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
A6NIN4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
A6NIN4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
A6NIN4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
A6NIN4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
A6NIN4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
A6NIN4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
A6NIN4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
A6NIN4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
A6NIN4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
A6NIN4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
A6NIN4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
A6NIN4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
A6NIN4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
A6NIN4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
A6NIN4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
A6NIN4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
A6NIN4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
A6NIN4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
A6NIN4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
A6NIN4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
A6NIN4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
A6NIN4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
A6NIN4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
A6NIN4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
A6NIN4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
A6NIN4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
A6NIN4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
A6NIN4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
A6NIN4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
A6NIN4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
A6NIN4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
A6NIN4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
A6NIN4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
A6NIN4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
A6NIN4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
A6NIN4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms