Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
U3KQE9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
U3KQE9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
U3KQE9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
U3KQE9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
U3KQE9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
U3KQE9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
U3KQE9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
U3KQE9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
U3KQE9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
U3KQE9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
U3KQE9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
U3KQE9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
U3KQE9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
U3KQE9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
U3KQE9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
U3KQE9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
U3KQE9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
U3KQE9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
U3KQE9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
U3KQE9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
U3KQE9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
U3KQE9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
U3KQE9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
U3KQE9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
U3KQE9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
U3KQE9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
U3KQE9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
U3KQE9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
U3KQE9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
U3KQE9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
U3KQE9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
U3KQE9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
U3KQE9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
U3KQE9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
U3KQE9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
U3KQE9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
U3KQE9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
U3KQE9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
U3KQE9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
U3KQE9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
U3KQE9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
U3KQE9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
U3KQE9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
U3KQE9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
U3KQE9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
U3KQE9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
U3KQE9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
U3KQE9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
U3KQE9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
U3KQE9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
U3KQE9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
U3KQE9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
U3KQE9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
U3KQE9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
U3KQE9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
U3KQE9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
U3KQE9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
U3KQE9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
U3KQE9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
U3KQE9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
U3KQE9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
U3KQE9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
U3KQE9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
U3KQE9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
U3KQE9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
U3KQE9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
U3KQE9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
U3KQE9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
U3KQE9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
U3KQE9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
U3KQE9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
U3KQE9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
U3KQE9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
U3KQE9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
U3KQE9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
U3KQE9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
U3KQE9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
U3KQE9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
U3KQE9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
U3KQE9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
U3KQE9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
U3KQE9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
U3KQE9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
U3KQE9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
U3KQE9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
U3KQE9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
U3KQE9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
U3KQE9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
U3KQE9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
U3KQE9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
U3KQE9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
U3KQE9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
U3KQE9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
U3KQE9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
U3KQE9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
U3KQE9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
U3KQE9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
U3KQE9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
U3KQE9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms