Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A3GALT2U3KPV4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms