Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ90

SPG7, Paraplegin, humanhuman

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG7Q9UQ90 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SPG7Q9UQ90 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SPG7Q9UQ90 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SPG7Q9UQ90 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SPG7Q9UQ90 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SPG7Q9UQ90 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SPG7Q9UQ90 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SPG7Q9UQ90 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SPG7Q9UQ90 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SPG7Q9UQ90 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SPG7Q9UQ90 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SPG7Q9UQ90 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SPG7Q9UQ90 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SPG7Q9UQ90 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SPG7Q9UQ90 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SPG7Q9UQ90 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
SPG7Q9UQ90 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SPG7Q9UQ90 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SPG7Q9UQ90 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SPG7Q9UQ90 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SPG7Q9UQ90 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SPG7Q9UQ90 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPG7Q9UQ90 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPG7Q9UQ90 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPG7Q9UQ90 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPG7Q9UQ90 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPG7Q9UQ90 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPG7Q9UQ90 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPG7Q9UQ90 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SPG7Q9UQ90 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPG7Q9UQ90 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPG7Q9UQ90 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPG7Q9UQ90 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPG7Q9UQ90 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPG7Q9UQ90 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPG7Q9UQ90 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SPG7Q9UQ90 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SPG7Q9UQ90 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SPG7Q9UQ90 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SPG7Q9UQ90 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SPG7Q9UQ90 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SPG7Q9UQ90 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
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