Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RABGEF1Q9UJ41 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RABGEF1Q9UJ41 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
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