Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CNTLNQ9NXG0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CNTLNQ9NXG0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CNTLNQ9NXG0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CNTLNQ9NXG0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CNTLNQ9NXG0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CNTLNQ9NXG0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CNTLNQ9NXG0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CNTLNQ9NXG0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CNTLNQ9NXG0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CNTLNQ9NXG0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CNTLNQ9NXG0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CNTLNQ9NXG0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CNTLNQ9NXG0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CNTLNQ9NXG0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CNTLNQ9NXG0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CNTLNQ9NXG0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CNTLNQ9NXG0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms