Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV29

TMEM100, Transmembrane protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM100Q9NV29 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM100Q9NV29 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM100Q9NV29 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TMEM100Q9NV29 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms