Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS62

THSD1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD1Q9NS62 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
THSD1Q9NS62 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
THSD1Q9NS62 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
THSD1Q9NS62 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms