Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX2

MRPL17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL17Q9NRX2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL17Q9NRX2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL17Q9NRX2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL17Q9NRX2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL17Q9NRX2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL17Q9NRX2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL17Q9NRX2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL17Q9NRX2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL17Q9NRX2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL17Q9NRX2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL17Q9NRX2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL17Q9NRX2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL17Q9NRX2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL17Q9NRX2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL17Q9NRX2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL17Q9NRX2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL17Q9NRX2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL17Q9NRX2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms