Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BATF3Q9NR55 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BATF3Q9NR55 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BATF3Q9NR55 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms