Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NTN4Q9HB63 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NTN4Q9HB63 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTN4Q9HB63 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTN4Q9HB63 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTN4Q9HB63 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NTN4Q9HB63 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTN4Q9HB63 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTN4Q9HB63 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTN4Q9HB63 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTN4Q9HB63 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTN4Q9HB63 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTN4Q9HB63 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTN4Q9HB63 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NTN4Q9HB63 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTN4Q9HB63 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTN4Q9HB63 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NTN4Q9HB63 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 266.6 ms