Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DCLK3Q9C098 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DCLK3Q9C098 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DCLK3Q9C098 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms