Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRRC3Q9BY71 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC3Q9BY71 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms