Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNRNP25Q9BV90 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNRNP25Q9BV90 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNRNP25Q9BV90 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms