Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE4

SELENOS, Selenoprotein S, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOSQ9BQE4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SELENOSQ9BQE4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SELENOSQ9BQE4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SELENOSQ9BQE4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SELENOSQ9BQE4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SELENOSQ9BQE4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SELENOSQ9BQE4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms