Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA3CQ99985 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SEMA3CQ99985 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SEMA3CQ99985 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms