Protein–RNA interactions for Protein: Q99732

LITAF, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAFQ99732 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LITAFQ99732 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LITAFQ99732 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms