Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAD9AQ99638 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD9AQ99638 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD9AQ99638 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms