Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RNF2Q99496 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RNF2Q99496 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms